Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm10509O88255 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10509O88255 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10509O88255 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm10509O88255 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10509O88255 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm10509O88255 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm10509O88255 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm10509O88255 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10509O88255 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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