Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Clec11aO88200 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clec11aO88200 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clec11aO88200 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec11aO88200 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms