Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly86O88188 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly86O88188 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly86O88188 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly86O88188 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly86O88188 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ly86O88188 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ly86O88188 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ly86O88188 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly86O88188 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly86O88188 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ly86O88188 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly86O88188 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly86O88188 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly86O88188 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly86O88188 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms