Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atf5O70191 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atf5O70191 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf5O70191 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atf5O70191 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf5O70191 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atf5O70191 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf5O70191 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf5O70191 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf5O70191 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf5O70191 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atf5O70191 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atf5O70191 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms