Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx4O55187 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx4O55187 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx4O55187 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx4O55187 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms