Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sap18O55128 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sap18O55128 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sap18O55128 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sap18O55128 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sap18O55128 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sap18O55128 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sap18O55128 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sap18O55128 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sap18O55128 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sap18O55128 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sap18O55128 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap18O55128 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap18O55128 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap18O55128 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap18O55128 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap18O55128 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sap18O55128 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sap18O55128 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap18O55128 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap18O55128 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms