Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap2O55126 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap2O55126 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms