Protein–RNA interactions for Protein: O55047

Tlk2, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlk2O55047 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlk2O55047 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlk2O55047 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlk2O55047 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlk2O55047 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlk2O55047 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms