Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnk2O54967 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnk2O54967 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnk2O54967 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms