Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChkaO54804 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkaO54804 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkaO54804 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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