Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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