Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ArxO35085 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ArxO35085 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ArxO35085 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ArxO35085 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ArxO35085 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ArxO35085 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ArxO35085 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ArxO35085 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ArxO35085 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArxO35085 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ArxO35085 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
ArxO35085 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ArxO35085 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ArxO35085 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ArxO35085 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ArxO35085 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ArxO35085 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ArxO35085 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ArxO35085 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ArxO35085 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ArxO35085 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ArxO35085 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ArxO35085 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ArxO35085 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ArxO35085 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ArxO35085 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ArxO35085 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ArxO35085 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ArxO35085 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ArxO35085 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ArxO35085 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ArxO35085 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ArxO35085 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ArxO35085 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ArxO35085 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ArxO35085 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ArxO35085 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ArxO35085 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ArxO35085 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArxO35085 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArxO35085 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArxO35085 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArxO35085 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArxO35085 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArxO35085 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArxO35085 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArxO35085 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArxO35085 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArxO35085 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ArxO35085 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ArxO35085 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ArxO35085 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ArxO35085 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ArxO35085 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ArxO35085 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ArxO35085 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ArxO35085 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ArxO35085 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ArxO35085 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ArxO35085 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ArxO35085 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ArxO35085 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ArxO35085 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ArxO35085 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ArxO35085 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ArxO35085 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ArxO35085 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ArxO35085 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ArxO35085 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ArxO35085 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ArxO35085 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArxO35085 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArxO35085 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArxO35085 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArxO35085 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArxO35085 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArxO35085 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArxO35085 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArxO35085 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArxO35085 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ArxO35085 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArxO35085 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArxO35085 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArxO35085 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArxO35085 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ArxO35085 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ArxO35085 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms