Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casq1O09165 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casq1O09165 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casq1O09165 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casq1O09165 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casq1O09165 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casq1O09165 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casq1O09165 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casq1O09165 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casq1O09165 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casq1O09165 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casq1O09165 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casq1O09165 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Casq1O09165 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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