Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4dO09126 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4dO09126 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sema4dO09126 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms