Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trove2O08848 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trove2O08848 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trove2O08848 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trove2O08848 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trove2O08848 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trove2O08848 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.4 ms