Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema3aO08665 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema3aO08665 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms