Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U90926O08546 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U90926O08546 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U90926O08546 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U90926O08546 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
U90926O08546 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U90926O08546 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U90926O08546 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U90926O08546 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U90926O08546 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U90926O08546 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U90926O08546 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U90926O08546 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U90926O08546 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U90926O08546 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U90926O08546 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U90926O08546 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U90926O08546 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U90926O08546 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U90926O08546 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U90926O08546 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U90926O08546 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U90926O08546 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U90926O08546 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U90926O08546 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U90926O08546 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U90926O08546 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U90926O08546 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U90926O08546 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U90926O08546 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U90926O08546 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U90926O08546 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U90926O08546 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U90926O08546 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U90926O08546 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U90926O08546 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U90926O08546 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U90926O08546 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U90926O08546 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U90926O08546 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U90926O08546 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U90926O08546 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U90926O08546 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U90926O08546 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U90926O08546 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U90926O08546 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
U90926O08546 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U90926O08546 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U90926O08546 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U90926O08546 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
U90926O08546 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms