Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm21962L7N280 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21962L7N280 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21962L7N280 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms