Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3248K7N721 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3248K7N721 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3248K7N721 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3248K7N721 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3248K7N721 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3248K7N721 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3248K7N721 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms