Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
2610008E11RikG3X964 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
2610008E11RikG3X964 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
2610008E11RikG3X964 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
2610008E11RikG3X964 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms