Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r39G3UWE6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r39G3UWE6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms