Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r76F8VQ63 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r76F8VQ63 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vmn1r76F8VQ63 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r76F8VQ63 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms