Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5218F6YH22 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5218F6YH22 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms