Protein–RNA interactions for Protein: F6Y113

Gm1110, Beta-galactosidase, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1110F6Y113 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm1110F6Y113 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm1110F6Y113 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm1110F6Y113 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1110F6Y113 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms