Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm1979E9QAN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm1979E9QAN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm1979E9QAN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gm1979E9QAN3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm1979E9QAN3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm1979E9QAN3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm1979E9QAN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm1979E9QAN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm1979E9QAN3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm1979E9QAN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm1979E9QAN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm1979E9QAN3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm1979E9QAN3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm1979E9QAN3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms