Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms