Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aknad1E9Q8N6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aknad1E9Q8N6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aknad1E9Q8N6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.54■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Aknad1E9Q8N6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms