Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051665E9Q623 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC051665E9Q623 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051665E9Q623 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BC051665E9Q623 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms