Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ythdc1E9Q5K9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ythdc1E9Q5K9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ythdc1E9Q5K9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc1E9Q5K9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms