Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r88E9Q235 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r88E9Q235 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r88E9Q235 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r88E9Q235 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms