Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc171E9Q1U1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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Ccdc171E9Q1U1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc171E9Q1U1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
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Ccdc171E9Q1U1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
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Ccdc171E9Q1U1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc171E9Q1U1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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