Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd2E9Q1M1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzd2E9Q1M1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd2E9Q1M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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