Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930426L09RikE9Q0N7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms