Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brd1E9PZ26 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd1E9PZ26 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Brd1E9PZ26 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brd1E9PZ26 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms