Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph10bE9PYQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph10bE9PYQ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms