Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28043E0CXC2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28043E0CXC2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28043E0CXC2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28043E0CXC2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms