Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930444G20RikD3Z741 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930444G20RikD3Z741 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930444G20RikD3Z741 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms