Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9330159F19RikD3Z623 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9330159F19RikD3Z623 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9330159F19RikD3Z623 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9330159F19RikD3Z623 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
9330159F19RikD3Z623 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9330159F19RikD3Z623 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9330159F19RikD3Z623 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
9330159F19RikD3Z623 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms