Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc78D3Z5T1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc78D3Z5T1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc78D3Z5T1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms