Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9630041A04RikD3Z3U4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9630041A04RikD3Z3U4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
9630041A04RikD3Z3U4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9630041A04RikD3Z3U4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms