Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930467E23RikD3Z1P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930467E23RikD3Z1P8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms