Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc170D3YXL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc170D3YXL0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc170D3YXL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc170D3YXL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc170D3YXL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc170D3YXL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc170D3YXL0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc170D3YXL0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc170D3YXL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms