Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Itga9B8JK39 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga9B8JK39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga9B8JK39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga9B8JK39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms