Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc11B2RXC1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc11B2RXC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc11B2RXC1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc11B2RXC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms