Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cspp1B2RX88 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cspp1B2RX88 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cspp1B2RX88 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms