Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cped1B2RX70 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cped1B2RX70 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cped1B2RX70 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cped1B2RX70 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms