Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ism1A2ATD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ism1A2ATD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ism1A2ATD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ism1A2ATD1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms