Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34c4A2ANA3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn34c4A2ANA3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c4A2ANA3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms