Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
AI481877A2ALV5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
AI481877A2ALV5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
AI481877A2ALV5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
AI481877A2ALV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
AI481877A2ALV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
AI481877A2ALV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
AI481877A2ALV5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
AI481877A2ALV5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
AI481877A2ALV5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
AI481877A2ALV5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms