Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm16A2A935 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prdm16A2A935 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm16A2A935 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Prdm16A2A935 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Prdm16A2A935 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Prdm16A2A935 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms